เต่าสี่ตัวที่ได้รับการฝึกฝนโดยที่ปรึกษาของพวกเขาในนินจิตสึต้องเรียนรู้ที่จะทํางานร่วมกันเพื่อเผชิญหน้ากับภัยคุกคามของ Shredder และ Foot Clan